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盘点 | 天昊微生物组(扩增子/宏基因组)+代谢组客户高分文章(医学/食品/农学)

发稿时间:2022-09-20来源:天昊生物

随着科学研究的不断深入,单一组学的结果越来越难以满足研究者对复杂生理过程调控机制的探究要求。多组学方法可以通过对多种组学数据的联合分析,更加全面的反映生物体内潜在的调控网络机制,提供了更多不同层次的结果证据。在多组学策略中,利用微生物组学(扩增子/宏基因组)和代谢组学联合分析的方法,是近几年的热门手段。今天小编就和大家来盘点一下天昊生物客户利用这两种组学技术在医学、食品和农学领域取得的成绩。

英文题目:Multi-omics reveals that Bifidobacterium breve M-16V may alleviate the immune dysregulation caused by nanopolystyrene

中文题目:多组学研究揭示短双歧杆菌M-16V可能缓解纳米聚苯乙烯引起的免疫失调

发表期刊:Environment International

影响因子:13.352 JCR分区:Q1

发表时间:20225

研究目的:探究短双歧杆菌M-16V是否可以缓解微塑料纳米聚苯乙烯(PS)的毒性

样本类型:小鼠粪便

检测方法:16S扩增子测序(V3-V4区) + LC-MS非靶向代谢组

取样策略:16S3个分组 x 6个重复;代谢组:2个分组 x 8个重复

研究内容:

研究利用两月龄的ICR小鼠(雄性和雌性)随机分为三组(每组8只):对照组(芝麻油)、暴露组(PS处理)和干预组(PS+M-16V处理)。这些组分别简称为对照组(Control)、暴露组(PS)、干预组(M-16V/PS+M-16V)。暴露一个月后,对小鼠实施安乐死并收集组织,粪便和肠道储存在-80°C,用于分析16S rDNA基因测序、组织病理学切片和RT-PCR

研究结论:

在本研究探讨了PS对免疫和微生物的影响,并通过多组学分析评估PS可能引起的小鼠健康问题。实验还试图揭示M-16V在维持宿主免疫系统和微生物组成之间平衡的重要功能。结果表明,PS改变了微生物组成,扰乱了氨基酸合成,增强了Th2炎症反应,导致免疫紊乱。而M-16V显示出对Th2Th17淋巴细胞亚群的抑制作用,伴随着MyD88表达的激活和IL-12的产生。此外,M-16V可能通过降低普雷沃氏菌、艾森伯格氏菌的相对丰度来部分恢复肠道菌群的生态失调。结果表明,短双歧杆菌M-16V通过宿主-微生物组相互作用具有一定的抗炎和免疫调节功能。


英文题目:The gut microbiota during the progression of atherosclerosis in the perimenopausal period shows specific compositional changes and significant correlations with circulating lipid metabolites

中文题目:围绝经期动脉粥样硬化进展过程中的肠道微生物群显示出特定的组成变化,并与循环脂质代谢物显著相关

发表期刊:Gut Microbes

影响因子:9.434 JCR分区: Q1

发表时间:20211

研究目的:探讨小鼠动脉粥样硬化(AS)与围绝经期肠道菌群的关系

样本类型:小鼠粪便及血清样本

检测方法:粪便16S扩增子测序(V3-V4区) + 血清脂质代谢组

取样策略:16S和代谢组:4个分组 x 8个重复;4个分组 x 5个重复

研究内容:

本研究利用8只雌性C57BL/624ApoE-/-小鼠,对其中的16ApoE-/-小鼠进行双侧卵巢切除术(OVX),其中8只进行90天的喂食高脂饮食(HFD),另外8ApoE-/-小鼠进行假手术并喂食HFD 90天,8C57BL/6小鼠作为对照组,进行假手术,维持正常饮食。其中8ApoE-/-小鼠每天灌胃雌激素(E),持续90天。其他小鼠每天灌胃无菌羧甲基纤维素钠。在另一项独立实验中,20ApoE-/-小鼠接受双侧卵巢切除术和HFD喂食90天。这些小鼠接受不同处理小鼠粪便的粪菌移植(FMT)实验,并进行粪便16S扩增子测序和血清脂质代谢组检测。

研究结论:

本研究首次报道了在围绝经期小鼠AS的进展过程中,肠道微生物群的特定变化伴随着血液脂质代谢物的变化。此外,分析肠道微生物群和脂质代谢组学之间的相关性表明,肠道微生物群在绝经期间的有益调节作用可能通过减轻脂质代谢紊乱来降低围绝经期心血管疾病的风险。此外,补充雌激素显着抑制更年期AS进展、高胆固醇血症和脂质代谢紊乱,也明显调节肠道微生物群。此外,通过粪便微生物群移植干预肠道微生物群足以改善绝经后小鼠的血脂、AS症状和脂质代谢紊乱。绝经期间补充雌激素可通过调节肠道菌群来延缓AS的进展并纠正脂质代谢紊乱。值得注意的是,这些发现为雌激素替代疗法提供了理论支持,并为了解围绝经期综合征提供了关于肠道微生物群和脂质代谢的详细实验证据。

英文题目:Exposure to a mixture of cigarette smoke carcinogens disturbs gut microbiota and influences metabolic homeostasis in A/J mice

中文题目:接触香烟烟雾混合致癌物会扰乱肠道微生物群并影响小鼠体内的代谢稳态

发表期刊:Chemico-Biological Interactions

影响因子:5.168 JCR分区: Q1

发表时间:20218

研究目的:探讨香烟烟雾致癌物对肺癌小鼠模型肠道微生物的影响

样本类型:小鼠粪便样本

检测方法:粪便16S扩增子测序(V3-V4区)+粪便LC-MS非靶向代谢组

取样策略:16S和代谢组:2个分组 x 7个重复

研究内容:

本研究利用对5-6周龄雌性A/J小鼠喂食AIN-93G食物。驯化1周后,将所有小鼠随机分为2组:对照组(小鼠口服等体积羧甲基纤维素钠水溶液)NNK-BaP(小鼠口服NNK 2μmol+BaP 2μmol混合物,每周2次,共8)。然后,在实验期间,小鼠被切换到AIN-93 M食物。处理结束时,处死小鼠并收获肺组织,对获得的不同组别小鼠肺部组织进行病理检测、粪便微生物群16S rRNA测序和粪便非靶向代谢组学分析。

研究结论:

本研究发现放线菌、双歧杆菌和肠杆菌水平的升高,以及理研菌、内脏异味杆菌和Acetatifactor菌水平的降低与NNKBaP触发的肺癌有关。代谢组学图谱揭示了相关的代谢调控,包括嘌呤代谢、苯丙氨酸代谢、初级胆汁酸生物合成、类固醇激素生物合成、不饱和脂肪酸生物合成、亚油酸代谢等。本文的结果可以为使用肠道微生物作为生物标志物来评估肺癌的进展提供一些指导,并为未来控制该疾病的发展带来了干预靶点。

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